Baltian maiden yhteisen laivasto-osastohankkeen käytännön valmistelut aloitettiin vuonna 1996, ja Saksa johti projektin kansainvälistä koordinointia. Laivasto-osaston (Baltic Naval Squadron, BALTRON) toiminta alkoi vuonna 1998. Viro vetäytyi BALTRON:in operatiivisesta toiminnasta vuonna 2015.

BALTRON:in tavoitteena on varmistaa Baltian maiden laivastojen jatkuva miinanraivausvalmius, valmius kansallisten tehtävien suorittamiseen sekä osallistuminen Naton johtamaan miinantorjuntaan. BALTRON edistää laivastojen yhteistoimintaa ja yhteensopivuutta sekä vahvistaa Baltian maiden merellistä turvallisuutta.

BALTRON on vakiintunut kolmen maan pysyvä merivoimajoukko, jonka erityisosaamisalueena on miinanraivaus. Osaston operatiivisena tehtävänä on miinauhkan ja ympäristövahinkojen torjunta Baltian maiden aluevesillä ja talousvyöhykkeillä sekä rauhanajan merenkulun turvallisuuden edistäminen. Hankkeen ensisijaisena tavoitteena on myötävaikuttaa kansallisten merivoimien kehitykseen ja lisätä Baltian maiden puolustuskykyä sekä kehittää yhteensopivuutta muiden Nato-maiden merivoimien kanssa.

BALTRON-osaston kokonpanoon kuuluu Baltian maiden merivoimien koulutuskeskus, joka sijaitsee Latviassa. Osaston johtovastuussa vuorottelevat Latvia ja Liettua vuoden kerrallaan. Vuonna 2024 johtovastuu oli Liettualla. Viro osallistuu merivoimien koulutuksellisiin yhteishankkeisiin.