Flygvapnets huvuduppgifter är att övervaka och skydda det tyska luftrummet och att upprätthålla flygvapnets beredskap för operationer.

Det har skett många stora förändringar i flygvapnets ledningsorganisation under 2000-talet, såsom uppställningar, nedläggningar och anslutningar. Som ett resultat av detta är den nuvarande ledningsorganisationen reducerad och förenklad. Under flygvapnets ledning lyder centret för luftoperationer (Kalkar), staben för flygvapnets trupper (Köln) samt de operativa förbanden och trupperna.

Ett stort antal flygvapenpersonal tjänstgör vid de i Tyskland belägna Natos integrerade luftförsvarsstaber och befattningsplatser till exempel. i Ramstein (Allied Air Command Ramstein) och i Geilenkirchen (NATO Airborne Early Warning & Control Force Command).

Flygvapnets sammansättning:

• 3 jaktplansregementen (Eurofighter),
• 2 jaktbombplansregementen (Eurofighter, Tornado),
• 1 spaningsflygregemente (Tornado, Heron),
• 2 transportflygregementen (Airbus A400M, Transall C-160D),
• 1 transporthelikopterregemente (Sikorsky CH-53),
• 1 transport- och lufttankningsregemente (Airbus A310 MRTT),
• 2 utbildningsenheter i Förenta staterna (Tornado, T-6, T-38),
• 1 områdesluftvärnsregemente samt objektsluftvärnsenheter (Patriot PAC-2/3, Mantis).

Flygvapnets utrustning:

• 230 stridsplan (140 Eurofighter, 88 Tornado),
• 4 lufttankningsplan (Airbus A310 MRTT),
• 40 transportplan (37 Airbus A400M, 3 C-130 Hercules), beställt sammanlagt 53 st. A400M och 6 Hercules,
• 88 helikoptrar (70 tunga transporthelikoptrar Sikorsky CH-53),
• 8 tunga fjärrstyrda obemannade spaningsflygplan (Heron),
• 14 områdesluftvärnsrobotbatterier (Patriot PAC 2/3),
• 2 närluftvärnsrobotbatterier (Mantis 35 mm).

Ett jaktbombplansregemente har ett Nato-kärnvapenuppdrag. Regementets Tornado-plan är utrustade för att bära taktiska kärnvapen (B-61-vätgasbomber), och regementets piloter är utbildade för uppgiften. Natos gemensamma kärnvapenavskräckning består av amerikanska kärnbomber stationerade i fyra västeuropeiska länder samt Turkiet. Dessa länders flygstyrkor är utbildade och utrustade för att bära kärnbomber, som förblir under amerikansk kontroll.

Tysklands Tornado-flotta föråldras och tas ur drift under 2020-talet och Luftwaffes nuvarande huvudflotta, Eurofighter Typhoon, lämpar sig inte för att bära kärnbomber. För att ersätta Tornado-flottan anskaffar Tyskland 15 Eurofighters och 35 F-35, varav F-35 planen ska tilldelas kärnvapenuppgifter.

CH-53 transporthelikoptrarna, som håller på att tas ur bruk, ersätts från och med 2025 med CH-47 Chinook-transporthelikoptrar, av vilka 60 har beställts.