Huvudsyftet med Estlands utrikespolitik är bevarandet av det estniska folket, språket och kulturen samt bevarande av statens självständighet och suveränitet.

Estlands utrikespolitik betonar utvecklingen av EU:s jurisdiktion, en regelbaserad internationell ordning och betydelsen av internationella organisationer och samarbete för att främja estniska intressen och som garanter för stabilitet, hållbar utveckling och säkerhet.

Ett särskilt mål är främjandet av digitalisering och internationell cybersäkerhet. Dessa uppnås genom att stärka internationell rätt, stärka EU:s och Natos operativa kapacitet samt bilateralt och multilateralt samarbete.

När Ryssland inledde anfallskriget mot Ukraina i februari 2022 blev det allra viktigaste målet för Estlands utrikespolitik att säkerställa bevarandet av Ukraina som en oberoende, suverän stat. Estland har stött Ukraina mest i förhållande till BNP bland EU-länderna.

I Estland anses Finlands Natomedlemskap vara viktigt och öka Estlands säkerhet.